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《通知》指出，全國污染源普查是重大的國情調查，是環境保護的基礎性工作。根據《全國污染源普查條例》規定，開展第二次全國污染源普查，掌握各類污染源的數量、行業和地區分布情況，了解主要污染物產生、排放和處理情況，建立健全重點污染源檔案、污染源信息數據庫和環境統計平臺，對于準確判斷我國當前環境形勢，制定實施有針對性的經濟社會發展和環境保護政策、規劃，不斷改善環境質量，加快推進生態文明建設，補齊全面建成小康社會的生態環境短板具有重要意義。
《通知》明確，普查的標準時點為2017年12月31日，時期資料為2017年度資料。普查對象是中華人民共和國境內有污染源的單位和個體經營戶。包括：工業污染源，農業污染源，生活污染源，集中式污染治理設施，移動源及其他產生、排放污染物的設施。普查內容包括普查對象的基本信息、污染物種類和來源、污染物產生和排放情況、污染治理設施建設和運行情況等。本次普查的具體范圍和內容，由國務院批準的普查方案確定。
《通知》強調，為加強組織領導，國務院決定成立第二次全國污染源普查領導小組，負責領導和協調全國污染源普查工作。領導小組辦公室設在環境保護部，負責普查的日常工作。領導小組成員單位要按照各自職責協調落實相關工作。本次普查工作經費，按照分級保障原則，由同級財政予以保障。中央財政負擔部分，由相關部門按要求列入部門預算。地方財政負擔部分，由同級地方財政根據工作需要統籌安排。
《通知》要求，污染源普查對象有義務接受污染源普查領導小組辦公室、普查人員依法進行的調查，并如實反映情況，提供有關資料，按照要求填報污染源普查表。任何地方、部門、單位和個人都不得遲報、虛報、瞞報和拒報普查數據，不得偽造、篡改普查資料。各級普查機構及其工作人員，對普查對象的技術和商業秘密，必須履行保密義務。
